1. غلظت بافر
غلظت بافر TRIS می تواند بر کارایی و دقت واکنش PCR تأثیر بگذارد. به طور کلی، غلظت بافر TRIS بین 10-100 میلی مولار مناسب است. اگر غلظت بافر خیلی کم باشد، می تواند منجر به pH ناپایدار سیستم واکنش شود که می تواند بر کارایی و دقت واکنش PCR تأثیر بگذارد. اگر غلظت بافر بیش از حد بالا باشد، ممکن است فعالیت پلیمراز را مهار کند و بر کارایی و دقت واکنش PCR تأثیر بگذارد.
2. pH بافر
pH بافر TRIS نیز بر کارایی و دقت واکنش PCR تأثیر می گذارد. به طور کلی pH یک واکنش PCR بین 8 است.{1}}.8. اگر PH بافر خیلی پایین باشد، ممکن است منجر به کاهش فعالیت پلیمراز شود که می تواند بر کارایی و دقت واکنش PCR تأثیر بگذارد. اگر pH بافر بیش از حد بالا باشد، ممکن است منجر به دناتوره شدن ناقص الگوی DNA شود که می تواند بر کارایی و دقت واکنش PCR تأثیر بگذارد.
3. قدرت یونی بافر
قدرت یونی بافر TRIS نیز بر کارایی و دقت واکنش PCR تأثیر می گذارد. به طور کلی، قدرت یونی بافر TRIS بین 50-150 میلی‌مولار است. اگر قدرت یونی بافر خیلی کم باشد، می تواند منجر به غلظت ناپایدار یون در سیستم واکنش شود که می تواند بر کارایی و دقت واکنش PCR تأثیر بگذارد. اگر قدرت یونی بافر بیش از حد بالا باشد، ممکن است فعالیت پلیمراز را مهار کند و بر کارایی و دقت واکنش PCR تأثیر بگذارد.
